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年份:
2013
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革(ge)命性(xing)的(de)第三(san)代(dai)測(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu) ---全(quan)長(chang)轉(zhuan)錄(lu)組,微生物基(ji)因組,基(ji)因組de novo 第三(san)代(dai)基(ji)因測(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)技(ji)術又被為 “Single Molecule Real Time (SMRTTM) DNA Sequencing”(單(dan)(dan)分子實(shi)時(shi)(shi)DNA測(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)技(ji)術),該方(fang)法基(ji)于納(na)米孔(kong)的(de)單(dan)(dan)分子讀(du)(du)取(qu)技(ji)術,不(bu)需要擴增即(ji)可(ke)快速(su)讀(du)(du)取(qu)序(xu)列。目前,Pacific Biosciences 公(gong)司已經成功推出了商業化(hua)的(de)第三(san)代(dai)測(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)儀(yi)PacBio RS平臺,使得(de)第三(san)代(dai)測(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)正式走(zou)入人們的(de)視角。 技(ji)術優勢: ? 更長(chang)的(de)測(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)讀(du)(du)長(chang) (平均(jun)讀(du)(du)長(chang)可(ke)超過(guo)10000 bp,有(you)超過(guo)50%的(de)讀(du)(du)長(chang)大(da)(da)于14000 bp),可(ke)大(da)(da)幅提高(gao)定位準確(que)性(xing)及拼接(jie)效率,有(you)利于闡釋(shi)基(ji)因組所發生的(de)變異以及大(da)(da)尺度結構重(zhong)排等(deng)信(xin)息(xi)并發現其相關(guan)的(de)生物學意義(yi)。? 單(dan)(dan)分子實(shi)時(shi)(shi)檢測(ce)(ce)(ce)(ce),模板制(zhi)備時(shi)(shi)無(wu)需PCR擴增,每一條模板鏈都可(ke)獲得(de)相應序(xu)列信(xin)息(xi),數據覆(fu)蓋均(jun)勻,準確(que);可(ke)以檢測(ce)(ce)(ce)(ce)稀有(you)變異;? 可(ke)同時(shi)(shi)獲得(de)動力(li)學信(xin)息(xi),可(ke)進行甲基(ji)化(hua)等(deng)修飾堿基(ji)的(de)直接(jie)測(ce)(ce)(ce)(ce)定;? 覆(fu)蓋深(shen)度幾乎(hu)不(bu)受序(xu)列中GC/AT含量差異的(de)影響;? 從樣本(ben)制(zhi)備到獲取(qu)序(xu)列信(xin)息(xi)簡便快捷; 參考文獻(xian)Donald S, Hagen T, Fabian G, et al. A single-molecule long-read survey of the human transcriptome [J]. Nature biotechnology, 2013.Flusberg B A, Webster D R, Lee J H, , et al. Direct detection of DNA methylation during single-molecule,real-time sequencing [J]. Nat Method, 2010.Chin C...